Please use this identifier to cite or link to this item:
https://hdl.handle.net/20.500.14279/8509
Title: | Έλεγχος της έκφρασης του γονιδίου ACAA2 Cacetyl-Coa acyltransferase 2 του προβάτου της φυλής Χίου | Authors: | Κωνσταντίνου, Κωνσταντίνα | Keywords: | acetyl-CoA acyltransferase;Πρόβειο γάλα;Πρόβατα της φυλής Χίου;Γονιδίου ACAA2 | Advisor: | Miltiadou, Despoina | Issue Date: | 2015 | Department: | Department of Agricultural Sciences, Biotechnology and Food Science | Faculty: | Faculty of Geotechnical Sciences and Environmental Management | Abstract: | Το ένζυμο ακετυλ-CoA ακυλοτρανσφεράση 2 (acetyl-CoA acyltransferase 2, ACAA2), το οποίο κωδικοποιείται από το γονίδιο ACAA2 καταλύει το τελευταίο στάδιο της β-οξείδωσης των λιπαρών οξέων. Κατά το πρώιμο στάδιο της γαλουχίας πληθαίνουν οι ενεργειακές ανάγκες του ήπατος για γλυκογένεση, οι οποίες ικανοποιούνται κυρίως από τη β-οξείδωδη των λιπαρών οξέων που οδηγούν στην αύξηση του ακέτυλο CoA (Vernon, 2005). Οι Orford et al., (2012), μελέτησαν για πρώτη φορά την ανίχνευση πολυμορφισμών ενός νουκλεοτιδίου (SNPs) του γονιδίου ACAA2, που πιθανόν να συσχετίζονται με τα παραγωγικά χαρακτηριστικά του πρόβειου γάλακτος σε πρόβατα της φυλής Χίου. Σε αυτή την έρευνα έγινε αλληλούχιση και γονοτύπηση του γονιδίου ACAA2 στα πρόβατα για πρώτη φορά. Βρέθηκε ένα SNP (C/T) στο εξώνιο 10 στην 3΄ αμετάφραστη περιοχή (untraslation region, UTR) του γονιδίου. Τα αποτελεσματα αυτής της έρευνας έδειξαν ότι ο ετεροζυγωτός γονότυπος CT και o ομοζυγωτός ΤΤ σχετίζονται με υψηλή γαλακτοπαραγωγή στα πρόβατα, ενώ αντίθετα ο γονότυπος CC συνδέεται με χαμηλή γαλακτοπαραγωγή. Τα δεδομένα της πιο πάνω μελέτης έδωσαν τη βάση για περαιτέρω έρευνα του γονιδίου ACAA2 των προβάτων της φυλής Χίου. Ο πολυμορφισμός αυτός πιθανόν να επηρεάζει την έκφραση του γονιδίου τόσο στο ήπαρ όσο και στο μαστό των προβάτων. Ως εκ τούτου, η παρούσα εργασία έχει ως στόχο τη μελέτη της έκφρασης των τριών διαφορετικών γονότυπων CC, TT και CT στο ήπαρ και στο μαστό των προβάτων της φυλής Χίου, καθώς και την έρευνα της διαφορετικής έκφρασης μεταξύ των δύο αλληλομόρφων T και C των ετεροζυγωτών ατόμων (CT). Χρησιμοποιήσαμε μεθόδους ελέγχου (α) της έκφρασης μεταξύ των τριών γονοτύπων CC/TT/CT (Real-Time PCR), (β) της έκφρασης μεταξύ των δύο αλληλομόρφων T και C των ετεροζυγωτών ατόμων CT (Taqman Real-Time PCR). Τα αποτελέσματά μας δείχνουν ότι το επίπεδο έκφρασης του γονοτύπου TT είναι μεγαλύτερο από το επίπεδο έκφρασης του CC γονοτύπου. Τα αποτελέσματα της διαφορετικής έκφρασης των δύο αλληλομόρφων T και C δεν έδειξαν στατιστικώς σημαντική διαφορά στην έκφρασή τους. Είναι απαραίτητο να γίνουν περαιτέρω μελέτες για τον προσδιορισμό του μοριακού μηχανισμού στον οποίο οφείλεται η διαφορετική έκφραση των δύο γονοτύπων. | Description: | The enzyme, acetyl-CoA acetyltransferase 2 (ACAA2), which is encoded by the ACAA2 gene, catalyzes the last stage of beta-oxidation of fatty acids. During the early stages of lactation there are growing energy needs for liver gluconeogenesis, which are met primarily by the beta-oxidation of fatty acids, thereby, leading to increased acetyl-CoA levels (Vernon, 2005). Orford et al. (2012) were the first to study the single nucleotide polymorphisms (SNPs) of the ACAA2 gene, which may correlate with the productive characteristics of the milk of Chios’ sheep. In their investigation, sequencing and genotyping of the ACAA2 gene were performed in sheep for the first time and showed that there is a SNP (C/T) in exon 10 of the 3 “untranslated region” (untraslation region, UTR) of the gene. The results of this research revealed that the heterozygous CT genotype and homozygous TT genotype were associated with high milk production in sheep, while the CC genotype was associated with low milk production. The findings of the above study provided the basis for further investigation of the ACAA2 gene of Chios’ sheep. Polymorphism is likely to affect gene expression in both liver and udder. Therefore, this project aims to study the expression of the three different genotypes, CC, TT and CT, in liver and udder of Chios’ sheep, and investigate the different expression between the two alleles, T and C, of heterozygous sheep (CT). We used control methods for (a) the expression of the three genotypes, CC/TT/CT (Real-Time PCR) and (b) the expression between the two alleles, T and C, of CT heterozygotes (Taqman Real-Time PCR). Our results show that the level of expression of the TT genotype is larger than that of the CC genotype. The differential expression of the two alleles, T and C, showed no statistically significant difference in their expression. There is a need for further studies to determine the molecular mechanism that is responsible for the difference in the expression of the two genotypes. | URI: | https://hdl.handle.net/20.500.14279/8509 | Rights: | Απαγορεύεται η δημοσίευση ή η αναπαραγωγή, ηλεκτρονική ή άλλη χωρίς τη γραπτή συγκατάθεση του δημιουργού και κατόχου των πνευματικών δικαιωμάτων | Type: | MSc Thesis | Affiliation: | Cyprus University of Technology |
Appears in Collections: | Μεταπτυχιακές Εργασίες/ Master's thesis |
Files in This Item:
File | Description | Size | Format | |
---|---|---|---|---|
Abstract.pdf | 141.21 kB | Adobe PDF | View/Open | |
Περίληψη.pdf | 186.11 kB | Adobe PDF | View/Open |
CORE Recommender
Page view(s) 50
261
Last Week
0
0
Last month
0
0
checked on Nov 6, 2024
Download(s) 50
128
checked on Nov 6, 2024
Google ScholarTM
Check
Items in KTISIS are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.