Please use this identifier to cite or link to this item:
https://hdl.handle.net/20.500.14279/18804| Title: | Μοριακή ανίχνευση Streptococcus agalactiae, Mycoplasma bovis, Staphylococcus aureus σε νωπό αγελαδινό γάλα | Authors: | Αυγουστή, Φύλιος | Keywords: | Μοριακή ανίχνευση;Streptococcus agalactiae;Mycoplasma bovis;Staphylococcus aureus;Νωπό αγελαδινό;QIAGEN bactotype Mastitis HP3 PCR Kit Handbook | Advisor: | Μπότσαρης, Γιώργος | Issue Date: | May-2020 | Department: | Department of Agricultural Sciences, Biotechnology and Food Science | Faculty: | Faculty of Geotechnical Sciences and Environmental Management | Abstract: | Η παρούσα πτυχιακή εργασία αναφέρεται στην μοριακή ανίχνευση τριών παθογόνων μικροοργανισμών, Streptococcus agalactiae, Mycoplasma bovis, Staphylococcus aureus, καθώς και στην απομόνωση DNA από νωπό αγελαδινό γάλα. Τα δείγματα πάρθηκαν από 51 κτηνοτροφικές εκτροφές από όλη την Κύπρο με την βοήθεια των Κτηνιατρικών Υπηρεσιών. Για την απομόνωση του DNA χρησιμοποιήθηκαν τρείς μέθοδοι. Οι πρώτες δύο ήταν γρήγορες και φτηνές μέθοδοι που παρασκευάστηκαν στο εργαστήριο. Η τρίτη μέθοδος αφορά ένα εργαστηριακό kit της εταιρείας QIAGEN το οποίο χρησιμοποιείται ανά το παγκόσμιο. Μετέπειτα ακολουθεί σύγκριση των τριών μεθόδων μεταξύ τους. Ο δεύτερος σκοπός της παρούσας διατριβής είναι η μοριακή ανίχνευση τριών παθογόνων μικροοργανισμών, ούτως ώστε, να μελετήσουμε τον επιπολασμό τους. Η μοριακή ανίχνευση χρησιμοποιεί το απομονωμένο DNA από τον πρώτο σκοπό. Από τα αποτελέσματα παρατηρούμε πως το Hp3 Mastidis Kit είναι η πιο αξιόπιστη μέθοδος από τις τρείς που έχουν διενεργηθεί στο πείραμα. Από τα αποτελέσματα της PCR παρατηρούμε πως παρ’ όλο που ορισμένα δείγματα συσχετίζονται μεταξύ τους, το Hp3 Mastidis Kit είναι πιο ευαίσθητη και εξειδικευμένη μέθοδος αφού χρειάζεται πιο λίγους κύκλους για να παρουσιάσει ένδειξη στο μηχάνημα της Real Time PCR, καθώς και παρουσιάζονται περισσότερα δείγματα θετικά στα παθογόνα από τις υπόλοιπες δυο. | Description: | The present dissertation refers to the molecular detection of three pathogenic microorganisms, Streptococcus agalactiae, Mycoplasma bovis, Staphylococcus aureus, as well as the isolation of DNA from raw cow milk. The samples were taken from 51 livestock farms from all over Cyprus with the help of the Veterinary Services. Three methods were used to isolate the DNA. The first two were quick and inexpensive methods prepared in the laboratory. The third method involves a laboratory kit from QIAGEN, which is used worldwide. This is followed by a comparison of the three methods. The second purpose of this dissertation is the molecular detection of three pathogenic microorganisms, so that we can study their prevalence. Molecular detection uses isolated DNA for the first purpose. From the results we observe that the Hp3 Mastidis Kit is the most reliable method of the three that have been performed in the experiment. From the PCR results we notice that although some samples are related, the Hp3 Mastidis Kit is a more sensitive and specialized method as it requires fewer cycles to display the Real Time PCR machine, and more samples are positive in pathogens from the other two. | URI: | https://hdl.handle.net/20.500.14279/18804 | Rights: | Απαγορεύεται η δημοσίευση ή αναπαραγωγή, ηλεκτρονική ή άλλη χωρίς τη γραπτή συγκατάθεση του δημιουργού και κάτοχου των πνευματικών δικαιωμάτων. Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International |
Type: | MSc Thesis | Affiliation: | Cyprus University of Technology |
| Appears in Collections: | Μεταπτυχιακές Εργασίες/ Master's thesis |
Files in This Item:
| File | Description | Size | Format | |
|---|---|---|---|---|
| Fylios Avgousti_2020_Abstract.pdf | Abstract | 287.46 kB | Adobe PDF | View/Open |
CORE Recommender
Page view(s)
173
Last Week
2
2
Last month
7
7
checked on Nov 21, 2024
Download(s)
79
checked on Nov 21, 2024
Google ScholarTM
Check
This item is licensed under a Creative Commons License
