1. Ktisis Cyprus University of Technology
  2. Cyprus University of Technology (Research Output)
  3. Μεταπτυχιακές Εργασίες/ Master's thesis
Please use this identifier to cite or link to this item: https://hdl.handle.net/20.500.14279/18804
DC FieldValueLanguage
dc.contributor.advisorΜπότσαρης, Γιώργος-
dc.contributor.authorΑυγουστή, Φύλιος-
dc.date.accessioned2020-08-28T11:45:58Z-
dc.date.available2020-08-28T11:45:58Z-
dc.date.issued2020-05-
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.14279/18804-
dc.descriptionThe present dissertation refers to the molecular detection of three pathogenic microorganisms, Streptococcus agalactiae, Mycoplasma bovis, Staphylococcus aureus, as well as the isolation of DNA from raw cow milk. The samples were taken from 51 livestock farms from all over Cyprus with the help of the Veterinary Services. Three methods were used to isolate the DNA. The first two were quick and inexpensive methods prepared in the laboratory. The third method involves a laboratory kit from QIAGEN, which is used worldwide. This is followed by a comparison of the three methods. The second purpose of this dissertation is the molecular detection of three pathogenic microorganisms, so that we can study their prevalence. Molecular detection uses isolated DNA for the first purpose. From the results we observe that the Hp3 Mastidis Kit is the most reliable method of the three that have been performed in the experiment. From the PCR results we notice that although some samples are related, the Hp3 Mastidis Kit is a more sensitive and specialized method as it requires fewer cycles to display the Real Time PCR machine, and more samples are positive in pathogens from the other two.en_US
dc.description.abstractΗ παρούσα πτυχιακή εργασία αναφέρεται στην μοριακή ανίχνευση τριών παθογόνων μικροοργανισμών, Streptococcus agalactiae, Mycoplasma bovis, Staphylococcus aureus, καθώς και στην απομόνωση DNA από νωπό αγελαδινό γάλα. Τα δείγματα πάρθηκαν από 51 κτηνοτροφικές εκτροφές από όλη την Κύπρο με την βοήθεια των Κτηνιατρικών Υπηρεσιών. Για την απομόνωση του DNA χρησιμοποιήθηκαν τρείς μέθοδοι. Οι πρώτες δύο ήταν γρήγορες και φτηνές μέθοδοι που παρασκευάστηκαν στο εργαστήριο. Η τρίτη μέθοδος αφορά ένα εργαστηριακό kit της εταιρείας QIAGEN το οποίο χρησιμοποιείται ανά το παγκόσμιο. Μετέπειτα ακολουθεί σύγκριση των τριών μεθόδων μεταξύ τους. Ο δεύτερος σκοπός της παρούσας διατριβής είναι η μοριακή ανίχνευση τριών παθογόνων μικροοργανισμών, ούτως ώστε, να μελετήσουμε τον επιπολασμό τους. Η μοριακή ανίχνευση χρησιμοποιεί το απομονωμένο DNA από τον πρώτο σκοπό. Από τα αποτελέσματα παρατηρούμε πως το Hp3 Mastidis Kit είναι η πιο αξιόπιστη μέθοδος από τις τρείς που έχουν διενεργηθεί στο πείραμα. Από τα αποτελέσματα της PCR παρατηρούμε πως παρ’ όλο που ορισμένα δείγματα συσχετίζονται μεταξύ τους, το Hp3 Mastidis Kit είναι πιο ευαίσθητη και εξειδικευμένη μέθοδος αφού χρειάζεται πιο λίγους κύκλους για να παρουσιάσει ένδειξη στο μηχάνημα της Real Time PCR, καθώς και παρουσιάζονται περισσότερα δείγματα θετικά στα παθογόνα από τις υπόλοιπες δυο.en_US
dc.formatpdfen_US
dc.language.isoelen_US
dc.publisherDepartment of Agricultural Science, Biotechnology and Food Science, Faculty of Geotechnical Science and Environmental Managment, Cyprus University of Technologyen_US
dc.rightsΑπαγορεύεται η δημοσίευση ή αναπαραγωγή, ηλεκτρονική ή άλλη χωρίς τη γραπτή συγκατάθεση του δημιουργού και κάτοχου των πνευματικών δικαιωμάτων.en_US
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International*
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/*
dc.subjectΜοριακή ανίχνευσηen_US
dc.subjectStreptococcus agalactiaeen_US
dc.subjectMycoplasma bovisen_US
dc.subjectStaphylococcus aureusen_US
dc.subjectΝωπό αγελαδινόen_US
dc.subjectQIAGEN bactotype Mastitis HP3 PCR Kit Handbooken_US
dc.subject.otherMolecular detectionen_US
dc.subject.otherStreptococcus agalactiaeen_US
dc.subject.otherMycoplasma bovisen_US
dc.subject.otherStaphylococcus aureusen_US
dc.subject.otherRaw cow milken_US
dc.subject.otherQIAGEN bactotype Mastitis HP3 PCR Kit Handbooken_US
dc.titleΜοριακή ανίχνευση Streptococcus agalactiae, Mycoplasma bovis, Staphylococcus aureus σε νωπό αγελαδινό γάλαen_US
dc.typeMSc Thesisen_US
dc.affiliationCyprus University of Technologyen_US
dc.relation.deptDepartment of Agricultural Sciences, Biotechnology and Food Scienceen_US
dc.description.statusCompleteden_US
cut.common.academicyear2019-2020en_US
dc.relation.facultyFaculty of Geotechnical Sciences and Environmental Managementen_US
item.languageiso639-1el-
item.cerifentitytypePublications-
item.fulltextWith Fulltext-
item.grantfulltextopen-
item.openairetypemasterThesis-
item.openairecristypehttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdcc-
crisitem.author.deptDepartment of Agricultural Sciences, Biotechnology and Food Science-
crisitem.author.facultyFaculty of Geotechnical Sciences and Environmental Management-
crisitem.author.orcid0000-0003-3197-6535-
crisitem.author.parentorgFaculty of Geotechnical Sciences and Environmental Management-
Appears in Collections:Μεταπτυχιακές Εργασίες/ Master's thesis
Files in This Item:
File Description SizeFormat
Fylios Avgousti_2020_Abstract.pdfAbstract287.46 kBAdobe PDFView/Open
CORE Recommender
Show simple item record

Page view(s)

163
Last Week
2
Last month
3
checked on Sep 27, 2024

Download(s)

79
checked on Sep 27, 2024

Google ScholarTM

Check


This item is licensed under a Creative Commons License Creative Commons