Please use this identifier to cite or link to this item:
https://hdl.handle.net/20.500.14279/30704| Title: | Γενετική Ανάλυση Μικροδορυφόρων Εγχώριου Βοοειδούς της Κύπρου | Authors: | Μιχαήλ, Σωτηρούλλα | Keywords: | Αυτόχθονες φυλές;Μικροδορυφορικοί δείκτες;Βοοειδή;Γενετική Ανάλυση | Advisor: | Miltiadou, Despoina | Issue Date: | May-2023 | Department: | Department of Agricultural Sciences, Biotechnology and Food Science | Faculty: | Faculty of Geotechnical Sciences and Environmental Management | Abstract: | Σκοπός της παρούσας εργασίας είναι η γενετική ανάλυση του εγχώριου βοοειδούς της Κύπρου με τη χρήση μικροδορυφόρων. Συγκεκριμένα διερευνήθηκαν 18 γενετικοί τόποι (TGLA227, BM2113, TGLA53, ETH10, SPS115, SPS113, RM067, TGLA126, TGLA122, INRA023, BM1818, CSRM60, MGTG4B, CSSM66, ILST006, ETH3, ETH225 και BM1824) οι οποίοι αφού ενισχύθηκαν με τη μέθοδο της Αλυσιδωτής Αντίδρασης Πολυμεράσης (PCR) γονοτυπήθηκαν στο Γενετικό Αναλυτή ABI PRISM 310 Genetic Analyzer προκειμένου να υπολογιστούν τα μεγέθη των αλληλομόρφων ανά γενετικό τόπο, τα οποία διαπιστώθηκαν με τη χρήση αυτόματου γενετικού αναλυτή (SeqStudio, Applied Biosystems) και του προγράμματος GeneMapper™. Ακολούθως, έγινε προκαταρτική σύγκριση της παραλλακτικότητας που υπάρχει σήμερα εντός της φυλής προκειμένου να μελετηθεί μελλοντικά ο ρόλος της στη διαμόρφωση των τοπικών οικοσυστημάτων και της βιοποικιλότητας. Έπειτα, συντελέστηκε προκαταρτική σύγκριση ανάμεσα σε αυτή και στις εμπορικά βελτιωμένες φυλές που εκτρέφονται στο νησί. Παράλληλα, μελετήθηκαν άλλες σπάνιες αυτόχθονες φυλές που συναντώνται στη Μεσόγειο και έγινε προσπάθεια να αποσαφηνιστεί η μοναδικότητα της κάθε μιας από αυτές και να υπογραμμιστεί η σημασία διαφύλαξης και διάσωσής τους. Συνολικά, τα προκαταρτικά πειράματα που διεξάχθηκαν στη παρούσα εργασία δείχνουν ότι το Εγχώριο Βοοειδές της Κύπρου εμφανίζει παρόμοια ή μεγαλύτερη παραλλακτικότητα εντός τους πληθυσμού συγκριτικά με την εμπορικά βελτιωμένη φυλή Holstein Friesian και παράλληλα παρατηρήθηκαν αρκετά κοινά αλληλόμορφα ανάμεσα στις δύο φυλές. Τα πρωτόκολλα που αναπτύχθηκαν και η απολυπλεξία των αλληλομόρφων θα αξιοποιηθούν περαιτέρω σε μελέτες με δειγματοληψία από το 10% του πληθυσμού ώστε να αποδειχθεί η μοναδικότητα της ντόπιας φυλής υπογραμμίζοντας παράλληλα την ανάγκη που υπάρχει για περαιτέρω διερεύνηση, αξιολόγηση και καταγραφή των ιδιαίτερων χαρακτηριστικών της και των προοπτικών αξιοποίησής της. | Description: | The aim of this postgraduate research is the genetic analysis of the domestic cattle of Cyprus using microsatellites. Specifically, 18 genetic loci were investigated (TGLA227, BM2113, TGLA53, ETH10, SPS115, SPS113, RM067, TGLA126, TGLA122, INRA023, BM1818, CSRM60, MGTG4B, CSSM66, ILST006, ETH3, ETH225 and BM1824) which after being amplified by the method of Polymerase Chain Reaction (PCR) were genotyped on the ABI PRISM 310 Genetic Analyzer to calculate allele sizes per locus, which were determined using an automated genetic analyzer (SeqStudio, Applied Biosystems) and the GeneMapper™ program. Afterwords, a comparison was made of the variability within the breed in order to study its future role in the formation of local ecosystems and biodiversity. Then, was made a comparison between the local breed and the conventional breeds raised on the island to see how genetically isolated it is. At the same time, other rare indigenous tribes found in the Mediterranean were studied and an attempt was made to clarify the uniqueness of each one of them and to underline the importance of preserving and rescuing them. Overall, the experiments conducted in this work show that the Cyprus Domestic Bovine shows similar or greater within-population variability compared to the commercially improved Holstein Friesian breed, and shared several alleles between the two breeds were also observed. The protocols developed and the polymorphism of the alleles will be further exploited in studies with sampling from 10% of the population to demonstrate the uniqueness of the local breed while underlining the need for further investigation, evaluation and recording of its special characteristics and perspectives its utilization. | URI: | https://hdl.handle.net/20.500.14279/30704 | Rights: | Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International | Type: | MSc Thesis | Affiliation: | Cyprus University of Technology |
| Appears in Collections: | Μεταπτυχιακές Εργασίες/ Master's thesis |
Files in This Item:
| File | Description | Size | Format | |
|---|---|---|---|---|
| Μιχαήλ Σωτηρούλλα_MSC_2023_ABSTRACT.pdf | abstract | 222.61 kB | Adobe PDF | View/Open |
CORE Recommender
Page view(s) 50
125
Last Week
2
2
Last month
7
7
checked on Nov 27, 2024
Download(s) 20
216
checked on Nov 27, 2024
Google ScholarTM
Check
This item is licensed under a Creative Commons License
