Please use this identifier to cite or link to this item:
https://hdl.handle.net/20.500.14279/27508| Title: | Νέο ρυθμιστικό διάλυμα απομόνωσης πυρήνων για εκτίμηση μεγέθους γονιδιώματος του αμπελιού με κυτταρομετρία ροής : Σύγκριση με κοινά ρυθμιστικά διαλύματα απομόνωσης | Authors: | Μιχαήλ, Κυριάκος | Keywords: | κυτταρομετρία ροής;ρυθμιστικά διαλύματα απομόνωσης;μεταβολίτες;ταννικό οξύ;συντελεστής παραλλακτικότητας | Advisor: | Νικολουδάκης, Νικόλαος | Issue Date: | May-2022 | Department: | Department of Agricultural Sciences, Biotechnology and Food Science | Faculty: | Faculty of Geotechnical Sciences and Environmental Management | Abstract: | Η κυτταρομετρία ροής (FCM) είναι μία τεχνική η οποία χρησιμοποιείται κατά κόρον για τη μελέτη εκατοντάδων-χιλιάδων κυτταρικών χαρακτηριστικών ανά δευτερόλεπτο και ως εκ τούτου είναι η τεχνική που επιλέγεται για αναλύσεις υψηλής απόδοσης λόγω ακρίβειας μετρήσεων και ταχύτητας. Τα φυτά όμως περιέχουν αρκετούς μεταβολίτες οι οποίοι μπορεί να παρεμποδίσουν την κυτταρική νηματική ροή και να αλληλοεπιδράσουν με χρωστικές που χρησιμοποιούνται στην κυτταρομετρία ροής για τη μελέτη μεγεθών γονιδιωμάτων (C-values). Ο στόχος της παρούσας μελέτης ήταν να αναπτυχθεί ένα καινούριο διάλυμα απομόνωσης πυρήνων από αμπέλι το οποίο να μη δημιουργεί προβλήματα παρεμπόδισης. Το φυτικό υλικό που χρησιμοποιήθηκε ήταν φύλλα (νεαρά και ώριμα) από ποικιλία Ξυνιστέρι. Για το διάλυμα χρησιμοποιήθηκαν σορβιτόλη/γλυκίνη και δείχθηκε η ικανότητα τους να εξουδετερώνουν τις ταννίνες/τανικά οξέα που προκαλούν παρεμβολές στην τεχνική. Το καινοφανές διάλυμα συγκρίθηκε με άλλα τρία διαλύματα τα οποία χρησιμοποιούνται για απομόνωση πυρήνων και βρέθηκε να υπερτερεί. Η σύγκριση μεταξύ των συντελεστών παραλλακτικότητας (CV) έδειξε ότι το διάλυμα σορβιτόλης/γλυκίνης είχε CV=4.06 %, γεγονός που υποδηλώνει καλύτερη απομάκρυνση μεταβολιτών σε σύγκριση με τα άλλα τρία διαλύματα [WPB (CV=7,69%), LB01(CV=6,69%) και Leal 2006(CV=7,13%)]. | Description: | Flow cytometry (FCM) is a technique that is widely used to study hundreds-thousands of cell characteristics per second and is therefore the technique of choice for high-performance assays due to measurement accuracy and speed. Plants, however, contain several metabolites that can inhibit cellular laminar flow and interact with dyes used in flow cytometry to study genome sizes (C-values). The aim of the present study was to develop a new buffer for vine nuclei isolation that does not cause interference problems. The plant material used was leaves (young and mature) from the Xinisteri variety. Sorbitol / glycine was used for the buffer and their ability to neutralize tannins / tannic acids that interfere with the technique was demonstrated. The novel buffer was compared with three other buffers used to isolate nuclei and was found to be superior. The comparison between the coefficients of variability (CV) showed that the sorbitol / glycine buffer had a CV = 4.06%, which indicates a better removal capacity of metabolites compared to the other three buffers [WPB (CV = 7.69%), LB01 (CV = 6.69%) and Leal 2006 (CV = 7.13%)]. | URI: | https://hdl.handle.net/20.500.14279/27508 | Rights: | Απαγορεύεται η δημοσίευση ή αναπαραγωγή, ηλεκτρονική ή άλλη χωρίς τη γραπτή συγκατάθεση του δημιουργού και κάτοχου των πνευματικών δικαιωμάτων. Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International |
Type: | Bachelors Thesis | Affiliation: | Cyprus University of Technology |
| Appears in Collections: | Πτυχιακές Εργασίες/ Bachelor's Degree Theses |
Files in This Item:
| File | Description | Size | Format | |
|---|---|---|---|---|
| Πτυχιακή Κυριάκος Μιχαήλ.pdf | Περίληψη | 138.49 kB | Adobe PDF | View/Open |
CORE Recommender
Page view(s)
54
Last Week
1
1
Last month
5
5
checked on May 1, 2024
Download(s)
50
checked on May 1, 2024
Google ScholarTM
Check
This item is licensed under a Creative Commons License
