http://ktisis.cut.ac.cy/handle/10488/15 Search the Channel search http://ktisis.cut.ac.cy/simple-search http://ktisis.cut.ac.cy/handle/10488/4802 Title: The mitigating effects of nitric oxide and hydrogen peroxide pre-treatments to salt-stressed strawberry plants<br/><br/>Authors: Christou, Anastasios; Manganaris, George A.; Papadopoulos, Ioannis; Fotopoulos, Vasileios<br/><br/>Abstract: Nitric oxide (NO) and hydrogen peroxide (H202) are reactive nitrogen and oxygen species with a well-documented signaling role necessary formaintenance of cell redox homeostasis. In the present study we tested whether hydroponic pre-treatment of strawberry (Fragaria x ananassa cv.Camarosa) roots to H202 (10 mM for 8 h) and sodium nitroprusside (SNP - NO donor; 100 ~M for 48 h), could induce long lasting priming effectsand tolerance to subsequent exposure to 100 mM NaCI for 8 d. Both root pre-treatments resulted in significantly reduced leaf chlorophyll degradation,ion leakage and lipid peroxidation levels in comparison with plants directly subjected to salt stress, suggesting a systemic mitigating effect ofNO and H202 pre-treatments to cellular damage resulting from abiotic stress factors. Furthermore, both pre-treatments lead to reduced de novosynthesis of NO and H202 in leaves following salt stress, minimizing oxidative and nitrosative stress in strawberry plants. Finally, an NaCI stressinduceddecrease in the ascorbate and glutathione redox state was partially prevented by both pre-treatments, providing strong evidence that H202and NO elicit increased systemic antioxidant activity in strawberry plants under salt stress conditions. Fri, 29 Oct 2010 22:58:59 GMT http://ktisis.cut.ac.cy/handle/10488/4801 Title: Characterization of the nitrosative status of citrus plants under various abiotic stress conditions<br/><br/>Authors: Ziogas, Vasileios; Tanou, Georgia; Filippou, Panagiota; Diamantidis, Grigoris; Fotopoulos, Vasileios; Molassiotis, Athanassios<br/><br/>Abstract: Nitric oxide (NO) is a key signaling molecule in plants. However, little is known about the metabolism of endogenous NO in plants under abioticstress conditions. Using citrus plants (Citrus aurantium L.) exposed to six different abiotic stress conditions (high light intensity, continuous dark,low and high temperature, drought and salinity), several aspects of the NO-related metabolism were investigated. Abiotic stress treatments inducedthe de novo production of NO in the leaves of plants, particularly in the case of high temperature and high light conditions. Increased NO productionwas localized in different leaf tissues by confocal laser scanning microscopy using the fluorescent probe 4,5-diaminofluorescin diacetate. Salinityand drought resulted in strong nitrosative DNA damage induced by peroxynitrite, further indicating that abiotic stress situations elicited nitrosativechallenges in citrus plants. S-nitroso glutathione reductase (GSNOR) appeared to playa signaling role in the high light, dark and high temperatureresponses. Protein Tyr-nitration targets were also characterized in leaves of citrus subjected to abiotic stress. Gene expression profiling experimentsrevealed that a wide array of NO-associated genes in citrus plants (including AOX, XO, GSNO, NOS, NiR and NR) were regulated by abiotic stressconditions. These results indicate that nitrosative responses are key components in the plant's behavior against environmental stimuli and providefurther insights into NO-mediated signaling. Fri, 29 Oct 2010 22:58:59 GMT http://ktisis.cut.ac.cy/handle/10488/4740 Title: Έλεγχος τρόπου κληρονόμησης της γαλακτοπαραγωγής και σχεδιασμός ανίχνευσης γονιδιακών τόπων ποσοτικών ιδιοτήτων (QTL) στο πρόβατο της φυλής Χίου<br/><br/>Authors: Χατζηπλής, Δ.; Τζαμαλούκας, Ουράνιος; Μαυρογένης, Α.; Κούμας, Α.; Παπαχριστοφόρου, Χ.; Μιλτιάδου, Δέσποινα<br/><br/>Abstract: Εισαγωγή- ΣκοπόςΟ τρόπος κληρονόμησης των ποσοτικών χαρακτήρων (π.χ. γαλακτοπαραγωγή), θεωρείται ότι είναι κάτω από πολυγονιδιακό έλεγχο. Τα τελευταία χρόνια οι ραγδαίες εξελίξεις στον τομέα της μοριακής γενετικής έδωσαν τη δυνατότητα ανίχνευσης γενωμικών περιοχών, οι οποίες περιέχουν γονίδια με μεγάλη δράση σε παραγωγικές ιδιότητες των αγροτικών ζώων, όπως η γαλακτοπαραγωγή. Σε αυτή την προκαταρκτική εργασία μελετάται ο τρόπος κληρονόμησης της γαλακτοπαραγωγής σε ένα πυρήνα προβάτων της φυλής Χίου, καθώς και δυνατότητα (power) ανίχνευσης γονιδιακών τόπων ποσοτικών ιδιοτήτων (QTL) για την ιδιότητα της γαλακτοπαραγωγής.Υλικά και Μέθοδοι Γενεαλογικά στοιχεία 32 ετών με 6965 επαναλαμβανόμενες μετρήσεις γαλακτοπαραγωγής, που συγκεντρώθηκαν από το Ινστιτούτο Γεωργικών Ερευνών της Κύπρου μελετήθηκαν με σκοπό την ανίχνευση πιθανής ολιγονιδιακής επίδρασης στη γαλακτοπαραγωγή του προβάτου της φυλής Χίου. Η μέθοδος η οποία χρησιμοποιήθηκε ήταν η ανάλυση διάσπασης μείζονος γονιδίου (Segregation analysis) βασισμένη στο θεώρημα του Bayes. Το πρόγραμμα ανάλυσης δεδομένων που χρησιμοποιήθηκε ήταν το MaGGic 4.0. Χρησιμοποιώντας τα αποτελέσματα της ανάλυσης διάσπασης μείζονος γονιδίου (εκτιμώμενο μέγεθος δράσης του μείζονος γονιδίου και εκτιμώμενες γενετικές παράμετροι του πληθυσμού) και τη γενεαλογική δομή του υφιστάμενου πληθυσμού, πραγματοποιήθηκε προσομοίωση και ανάλυση σύνδεσης για την ανίχνευση QTL με την χρήση της μεθοδολογίας συστατικών παραλλακτικότητας, με σκοπό την εκτίμηση της δυνατότητας ανίχνευσης QTL (power) στον πυρήνα των προβάτων φυλής Χίου του Ι.Γ.Ε.ΑποτελέσματαΤα αποτελέσματα της ανάλυση διάσπασης μείζονος γονιδίου δείχνουν υψηλή πιθανότητα διάσπασης μείζονος γονιδίου στον συγκεκριμένο πληθυσμό των προβάτων της φυλής Χίου. Η a posteriori κατανομή της παραλλακτικότητας της δράσης του μείζονος γονιδίου είναι κατά πολύ μεγαλύτερη από αυτή της πολυγονιδιακής κληρονόμησης. Παρόλα αυτά, η a posteriori κατανομή της παραλλακτικότητας της πολυγονιδιακής κληρονόμησης παραμένει σημαντικά μεγαλύτερη του μηδενός. Τα παραπάνω ενισχύουν την άποψη ενός μεικτού προτύπου κληρονόμησης της γαλακτοπαραγωγής στο Χιακό πρόβατο. Δηλαδή, ένα τμήμα της γαλακτοπαραγωγής του Χιακού προβάτου ελέγχεται από ένα γονίδιο με μεγάλη δράση (μείζον γονίδιο) ενώ το υπόλοιπο ελέγχεται από πολλά γονίδια με μικρή δράση.Η συχνότητα του μείζονος γονιδίου στον πληθυσμό εκτιμάται να είναι 0.74. Η αθροιστική δράση του μείζονος γονιδίου εκτιμάται στα 45,6 κιλά γάλα ανά γαλακτική περίοδο, ενώ η κυριαρχική δράση στα -39,4 κιλά ανά γαλακτική περίοδο! Ο συντελεστής κληρονομικότητας του μείζονος γονιδίου, με την μεθοδολογία Bayes, εκτιμάται ως 0,38, του πολυγονιδιακού τμήματος ως 0,10, ενώ ο συντελεστής κληρονομικότητας του μεικτού προτύπου (μείζονος γονιδίου και πολυγονιδιακού τμήματος) είναι 0,47. Ο συντελεστής κληρονομικότητας εκτιμώμενος με βάση πολυγονιδιακό πρότυπο και ανάλυση μέγιστης πιθανοφάνειας (REML) εκτιμάται ως 0,21.Έπειτα από ανάλυση σύνδεσης προσομοιωμένου QTL με αθροιστική μόνο δράση 45,6 κιλών γάλακτος ανά γαλακτική περίοδο και χρησιμοποιώντας τη γενεαλογική δομή του υφιστάμενου πληθυσμού προβάτων της φυλής Χίου του Ι.Γ.Ε. εκτιμάται ότι υπάρχει 50% πιθανότητα να εντοπισθεί ένα QTL, εφόσον υπάρχουν μοριακοί γενετικοί δείκτες με μέση απόσταση 10cM μεταξύ τους. Εάν η πυκνότητα των μοριακών γενετικών δεικτών διπλασιασθεί, τότε η πιθανότητα αυτή αυξάνεται κατά 20%.Συμπεράσματα Η ανάλυση διάσπασης μείζονος γονιδίου αποτελεί μόνο ένδειξη του τρόπου κληρονόμησης μιας ιδιότητας και όχι απόδειξη διάσπασης ενός γονιδίου. Μπορεί όμως να αποτελέσει ένα ισχυρό εργαλείο για την προκαταρκτική εξέταση υποψηφίων παραγωγικών ιδιοτήτων για ανάλυση σύνδεσης QTL με υφιστάμενους πολυμορφισμούς. Επίσης, η παραπάνω ανάλυση, κατά Bayes, δίνει τη δυνατότητα επιλεκτικής γονοτύπησης οικογενειών χρησιμοποιώντας την a posteriori κατανομή των πιθανοτήτων των γονότυπων των ζώων.Τα αποτελέσματα της ανάλυσης διάσπασης μείζονος γονιδίου σε αυτή τη μελέτη αν και ενθαρρυντικά δημιουργούν ορισμένα ερωτήματα όσον αφορά στην αρνητική κυριαρχική δράση. Το πρώτο βήμα προς την διαλεύκανση τέτοιων ερωτημάτων θα προερχόταν απευθείας από το γενετικό κώδικα των ζώων μέσω της ανίχνευσης QTL. Αν και η δυνατότητα ανίχνευσης QTL στον πληθυσμό είναι μέτρια, η χρήση διαφορετικής μεθόδου ανάλυσης των μοριακών δεδομένων (π.χ. μέθοδος των ετεροθαλών οικογενειών), αναμένεται να αυξήσει τη δυνατότητα ανίχνευσης QTL.ΕυχαριστίεςΗ έρευνα χρηματοδοτήθηκε από το Ίδρυμα Προώθησης Έρευνας Κύπρου και το Τεχνολογικό Πανεπιστήμιο Κύπρου. Wed, 29 Oct 2008 22:58:59 GMT http://ktisis.cut.ac.cy/handle/10488/4739 Title: Identification of established genetic variants associated with milk traits<br/><br/>Authors: Orford, Michael; Tzamaloukas, Ouranios; Papachristoforou, Christakis; Koumas, Alkis; Hadjipavlou, Georgia; Miltiadou, Despoina<br/><br/>Abstract: The present study investigated the genetic diversity of small ruminant breeds of Cyprus, regarding β-lactoglobulin (β-LG) genotypes and the existence of bovine single nucleotide polymorphisms (SNPs). In total, 366 animals belonging to the Chios and Cyprus fat-tailed sheep breeds, and to the Damascus and Machaeras goat breeds, were genotyped for the identification of the most common β-lactoglobulin variants (A and B), as well as for the presence of the growth hormone receptor (GHR) F279Y and the acylCoA:diacylglycerol acyltransferase 1 (DGAT1) K232A SNPs. With regard to β-lactoglobulin genotypes, two genetic variants (A and B) were identified for the sheep breeds and only one variant (A) for the goat breeds. The results showed that variant B of β-LG gene was not present in any caprine sample and therefore a fixed A-allelic genotype was suggested for both goat breeds. However, the present study showed that the Cyprus fat-tailed sheep was predominantly of the β-LG B type demonstrating significant differences in allelic frequencies (P < 0.001) and genotypic distributions (P < 0.05) compared to Chios sheep, revealing unusually high distribution of the BB genotype (38.5% of the total genotypes) as compared to Chios (4.5%) or other Mediterranean sheep breeds. With regard to bovine SNPs, the present study investigated the existence of GHR F279Y and the DGAT1 K232A SNPs, which have both been previously well documented in cattle as having strong effects on milk yield and composition. Although we were able to confirm the presence of both of these mutations in bovine sample controls by both allele specific PCR reactions and direct DNA sequencing, we were unable to detect them in all four major pure breeds of sheep and goats supporting the small ruminant dairy industry in Cyprus. Thu, 29 Oct 2009 22:58:59 GMT